在《微软飞行模拟》 40周年纪念版中，飞行时需要先选择并熟悉机型及其操作界面，设置GPS航线（可选），然后按照起飞流程进行操作，例如打开发动机、调整襟翼和油门等，飞机起飞后，可以通过方向键或自动驾驶功能调整飞行方向。着陆时，需要关闭自动飞行、放下起落架、减小油门、触地、打开减速板、打开反推力和制动，最后关闭发动机。
《微软飞行模拟40周年纪念版》 飞机操作指南：基础控制:
暂停：P 或BREAK
全屏：ALT + ENTER
菜单显示/隐藏：ALT
ATC 菜单：` 或SCROLL LOCK
膝板显示/隐藏：SHIFT+F10
声音开关：Q
重置飞行：CTRL+；
保存航班：
退出飞行模拟器：CTRL+C
立即退出：CTRL+BREAK
操纵杆控制：CTRL+K
全局坐标/帧速率：SHIFT+Z
截图：V
登机桥停靠/脱离：CTRL+J
飞行结束：ESC
飞机控制指令：
副翼左/右倾斜：数字键盘4/6
副翼左/右微调：CTRL+数字键盘4/6
垂尾左/右偏航：数字键盘0/ENTER
垂尾左/右修剪：CTRL+数字键盘0/ENTER
居中控制：数字键盘5
水平升降机下/上：数字键盘8/2
电梯向下/向上修整：数字键盘7/1
襟翼操作：F5（完全收回）、F6（缓慢收回）、F7（缓慢伸出）、F8（完全伸出）
扰流板/减速板：/
剧透警告：SHIFT+/
水舵收回/释放：CTRL+W
发动机控制指令：
选择发动机：E+发动机号（1-4）
自动启动引擎：CTRL+E
切断/加大油门：F1/F3或数字键盘3/9
最大油门：F4
螺旋桨速度控制：CTRL+F1（低）、CTRL+F2（减小）、CTRL+F3（增大）、CTRL+F4（高）
油气混合比调整：CTRL+SHIFT+F1（怠速低油）至CTRL+SHIFT+F4（高油）
发动机除冰：H
磁电机选择：M
电池组/发电机选择：SHIFT+M
喷气发动机启动器：J
直升机旋翼控制：SHIFT+。 （离合器）、SHIFT+、（调节器）、SHIFT+B（制动器）
通用飞机控制指令：
驻车制动：CTRL+。
推回操作：SHIFT+P（1/2控制方向）
制动控制： （总计）、数字键盘+（左）、数字键盘-（右）
起落架：G（收起/伸出）、SHIFT+G（尾轮锁定）、CTRL+G（手动释放）
燃油供给：CTRL+SHIFT+D
子面板显示：SHIFT+1 至9
排烟系统：I
整流罩控制：CTRL+SHIFT+V（开）、CTRL+SHIFT+C（关）
牵引/牵引：SHIFT+P（请求）、CTRL+SHIFT+Y（请求牵引）、SHIFT+Y（释放牵引）
舱口控制：SHIFT+E（1-4选择开关）
灯光指令：
灯总开关：L
外部闪光灯警告：O
面板灯：SHIFT+L
着陆灯：CTRL+L（开关）、CTRL+SHIFT+数字键盘（方向调节）
视野指令：
驾驶舱循环：W
面板视图：SHIFT+数字键盘0
视场转换：S/SHIFT+S、A/SHIFT+A
恢复默认视图：BACKSPACE
鼠标指针：SHIFT+O（开/关）、空格键（按住指针）
视图窗口：[（开）、]（关）、SHIFT+]（顶视图）
虚拟驾驶舱：F9
2D驾驶舱：F10
跟踪视野：F11
卫星视图：F12
透明度调整：CTRL+SHIFT+T (+/-)
放大/缩小：=/-
切换视野：CTRL+TAB/CTRL+SHIFT+TAB
视点移动：CTRL/SHIFT+方向键/ENTER等
移位指令：
换档模式：Y
北航向/直线姿态：CTRL+SPACE
冻结移动：数字键5
位置移动：数字键盘8/2/4/6
高度调节：Q/A（慢）、F4/F1（快）
俯仰/倾斜控制：数字键盘9/7/0/F5/F8等
任务指令：
指南针指示器：U
目标指示：K/SHIFT+K
无线电指令：
ATC 窗口：` 或SCROLL LOCK
VOR/MKR/DME/ADF 识别：CTRL+1 至5
交替频率：X
无线电选择：C/N
OBS 指示器：SHIFT+V
雷达收发器：T
自动驾驶指令：
主开关：Z
飞行指挥：CTRL+F
机翼水平调节器：CTRL+V
偏航阻尼器：CTRL+D
高度保持：CTRL+Z（选择CTRL+SHIFT+Z）
航线保持：CTRL+H（选择CTRL+SHIFT+H）
空速/马赫数保持：CTRL+R/M（SHIFT+R 是另一种空速保持）
TOGA 模式：CTRL+SHIFT+G
NAV1 保留：CTRL+N
进场/返航模式：CTRL+A/B
保持左右定位：CTRL+O
保持姿势：CTRL+T
